Na época do descobrimento, o vasto planalto hoje pertencente ao território de Jaquirana era ocupado por índios Kaigangs.
No século XVII, chegaram os missionários jesuítas e implantaram a criação extensiva de gado. Os bandeirantes paulistas também lá estiveram, exercendo suas atividades escravagistas e buscando os rebanhos deixados pelos jesuítas.
No início do século XVIII os europeus e luso-brasileiros começam a marcar sua presença na região, representados por tropeiros e contrabandistas de gado. Em 1807, o Rio Grande do Sul cria a sua primeira estrutura administrativa territorial, formando quatro municípios. Um deles era Santo Antônio da Patrulha, que integrou o município de Jaquirana em seu território até 1878. A partir daí, a região onde hoje é Jaquirana passa a pertencer a São Francisco de Paula, emancipando-se em 1987.
O nome do município é de origem indígena e significa cigarra cantadeira.
Atrativos
Em Nova Prata
Cascata da Usina.
Formada pelas águas do Rio da Prata, a Cascata da Usina possui uma queda de 45 metros de água sobre um poço de aproximadamente 7 metros de profundidade e se esparrama formando um lago natural encravado no leito de basalto. O local é cercado por vegetaç&at.
Localiza-se na na rodovia BR 116, km 130 - Distante 13 km da sede - É rico em vegetação subtropical.Possui quatro pequenas cascatas distribuídas em diferentes pontos do rio.No verão seu acesso se torna mais fácil, devido à redução do n&i.
Atrativo de grandiosa beleza, localizada no Arroio Sapatinho fica distante 6 km da sede do município. De fácil acesso, realizado pela Linha Independência, por estrada não pavimentada, onde é possível observar vales e morros. No local existem vários alm.
