Na época do descobrimento, o vasto planalto hoje pertencente ao território de Jaquirana era ocupado por índios Kaigangs.
No século XVII, chegaram os missionários jesuítas e implantaram a criação extensiva de gado. Os bandeirantes paulistas também lá estiveram, exercendo suas atividades escravagistas e buscando os rebanhos deixados pelos jesuítas.
No início do século XVIII os europeus e luso-brasileiros começam a marcar sua presença na região, representados por tropeiros e contrabandistas de gado. Em 1807, o Rio Grande do Sul cria a sua primeira estrutura administrativa territorial, formando quatro municípios. Um deles era Santo Antônio da Patrulha, que integrou o município de Jaquirana em seu território até 1878. A partir daí, a região onde hoje é Jaquirana passa a pertencer a São Francisco de Paula, emancipando-se em 1987.
O nome do município é de origem indígena e significa cigarra cantadeira.
Atrativos
Em São José dos Ausentes
Cachoeirão dos Rodrigues.
Localiza-se no 2º distrito do município de São José dos Ausentes, a 33km da sede, com acesso pela estrada municipal Silveira..
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Os tropeiros cruzaram o Brasil, comercializando animais e produtos para subsistência das populações locais ao longo de suas rotas. Por sua localização geográfica estratégica, Bom Jesus foi uma das cidades que se formaram ao longo dos caminhos trilhados.
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