No início da colonização, era apenas uma vila do interior de Veranópolis, conhecida por Pinheiro Seco. Em 1920, passou a ser chamada de Vila Flores, em homenagem à Família Fiori, uma das primeiras a se estabelecerem na localidade. Emancipou-se em 12 de maio de 1988.
O povoado formou-se a partir da Casa Fiori, onde no início do século passado funcionava o maior estabelecimento comercial da região. O local foi porto de pouso dos carreteiros que transportavam madeira para Porto Alegre.
As toras eram levadas até o rio das Antas e amarradas na forma de balsas. Quando a água subia, as madeiras eram colocadas no rio para descerem flutuando até a capital gaúcha. Hoje, a cidade de Vila Flores é ponto de referência de religiosos que vêm em busca do famoso vinho de missa, fabricado no Seminário dos Freis Capuchinhos.
Atrativos
Em São Francisco de Paula
Igreja Matriz.
Igreja ampla, inaugurada em 14 de junho de 1964, retrata, no seu interior, a devoção do povo serrano, com um interessante conjunto de vitrais. À frente do templo há uma imagem do padroeiro da cidade, São Francisco de Paula, feita com material reciclado. As Portas d.
A capela São Roque está situada à beira do rio da Prata à ponte que liga o município de Vila Flores a Antônio Prado, situa-se no lugar aprazível. Nos fins de semana, em época de verão ela é muito visitada por turistas e outras pess.
O ano de construção da igreja, 1862, foi considerado o ano da fundação desta comunidade. Até 1874 esta era a única igreja em toda a região de Santa Maria do Mundo Novo.
Em estilo enxaimel, e servia a diferentes gruposs religiosos por se a únic.
