Na época do descobrimento, o vasto planalto hoje pertencente ao território de Jaquirana era ocupado por índios Kaigangs.
No século XVII, chegaram os missionários jesuítas e implantaram a criação extensiva de gado. Os bandeirantes paulistas também lá estiveram, exercendo suas atividades escravagistas e buscando os rebanhos deixados pelos jesuítas.
No início do século XVIII os europeus e luso-brasileiros começam a marcar sua presença na região, representados por tropeiros e contrabandistas de gado. Em 1807, o Rio Grande do Sul cria a sua primeira estrutura administrativa territorial, formando quatro municípios. Um deles era Santo Antônio da Patrulha, que integrou o município de Jaquirana em seu território até 1878. A partir daí, a região onde hoje é Jaquirana passa a pertencer a São Francisco de Paula, emancipando-se em 1987.
O nome do município é de origem indígena e significa cigarra cantadeira.
Atrativos
Em Flores da Cunha
Igreja Matriz Nossa Senhora de Lourdes e Campanário de Pedra .
Sua construção foi concluída em 1914. É uma das mais antigas do estado no estilo gótico. Possui um altarmor oriundo da Itália, com três nichos, sendo que no central, por influência dos padres capuchinhos franceses, está a Nossa Senhora de .
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Segundo o historiador e Cônego José Baréa, a primeira "Igreja" foi uma cabanazinha feita de taquaras, no antigo cemitério, na rua Bento Gonçalves, em Caxias do Sul.O tabernáculo, para guarda do Santíssimo, era a caixa de um velho relógio de pare.
A Igreja Matriz São José foi construída em 1945. As obras foram concluídas dois anos depois e a inauguração aconteceu com a missa do celebrada pelo padre João Pazza. A igreja está localizada no centro de Cambará do Sul, na praça p.
Encontra-se na Capela de Nossa Senhora da Pompéia, na Linha Júlio de Oliveira à 4 km da sede do município. A Gruta possui formação natural, constituída por um paredão de pedra basalto, com aproximadamente 18m de largura, 9m de profundidade e 5m.
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