Na época do descobrimento, o vasto planalto hoje pertencente ao território de Jaquirana era ocupado por índios Kaigangs.
No século XVII, chegaram os missionários jesuítas e implantaram a criação extensiva de gado. Os bandeirantes paulistas também lá estiveram, exercendo suas atividades escravagistas e buscando os rebanhos deixados pelos jesuítas.
No início do século XVIII os europeus e luso-brasileiros começam a marcar sua presença na região, representados por tropeiros e contrabandistas de gado. Em 1807, o Rio Grande do Sul cria a sua primeira estrutura administrativa territorial, formando quatro municípios. Um deles era Santo Antônio da Patrulha, que integrou o município de Jaquirana em seu território até 1878. A partir daí, a região onde hoje é Jaquirana passa a pertencer a São Francisco de Paula, emancipando-se em 1987.
O nome do município é de origem indígena e significa cigarra cantadeira.
Atrativos
Em São Francisco de Paula
Parque da Cachoeira.
Área com influência dos rios Cará e Santa Cruz, localizada a cerca de 40 quilômetros da sede do município, nas imediações da ponte de ferro da estrada que segue a Bom Jesus (Km 10). O parque tem tobo-água, pedalinhos, piscinas naturais, trilhas, .
Distante apenas 12 km do centro de Cambará do Sul, o Lajeado da Margarida é um recanto para visitantes e moradores. Formado pelo Rio Camisas, o Lajeado apresenta mais de 50 metros de extensão. No inverno a paisagem é contemplativa, no verão além de apreciar .
O parque Cascata dos Monges foi inaugurado no dia 06 de novembro de 1998. Há milhões de anos, o contato da água com a rocha, possibilitou a formação de figuras que lembram os três monges.O parque é de propriedade do senhor Carmelindo Andreazza, e possu.
