Na época do descobrimento, o vasto planalto hoje pertencente ao território de Jaquirana era ocupado por índios Kaigangs.
No século XVII, chegaram os missionários jesuítas e implantaram a criação extensiva de gado. Os bandeirantes paulistas também lá estiveram, exercendo suas atividades escravagistas e buscando os rebanhos deixados pelos jesuítas.
No início do século XVIII os europeus e luso-brasileiros começam a marcar sua presença na região, representados por tropeiros e contrabandistas de gado. Em 1807, o Rio Grande do Sul cria a sua primeira estrutura administrativa territorial, formando quatro municípios. Um deles era Santo Antônio da Patrulha, que integrou o município de Jaquirana em seu território até 1878. A partir daí, a região onde hoje é Jaquirana passa a pertencer a São Francisco de Paula, emancipando-se em 1987.
O nome do município é de origem indígena e significa cigarra cantadeira.
Atrativos
Em São Marcos
Praça Dante Marcucci.
Localizada no centro da cidade, a Praça Dante Marcucci é um dos mais belos pontos do município.Um centro de cultura e lazer da população..
Construída em 1932, em estillo gótico, ostenta duas torres de 49 metros de altura. O piso é feito de lajotas decoradas e detalhes em mármore. O altar foi projetado por Alexandre Bartelle. Há ainda belos vitrais.A Igreja Matriz Sagrado Coração de Jesus.
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Construída em 1929, através da união de diversas famílias da comunidade, a Gruta é mais um exemplo de religiosidade e associativismo dos imigrantes e seus descendentes. Antigo ponto de parada para matar a sede e dar de beber aos animais, até hoje as pessoas .
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Um local de muita devoção é a Gruta de Nossa Senhora de Lourdes. Poucas informações temos sobre sua origem. Segundo o depoimento de pessoas mais idosas, no final de década de 1920, houve um movimento para a construção de uma gruta, em homenagem.
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