Na época do descobrimento, o vasto planalto hoje pertencente ao território de Jaquirana era ocupado por índios Kaigangs.
No século XVII, chegaram os missionários jesuítas e implantaram a criação extensiva de gado. Os bandeirantes paulistas também lá estiveram, exercendo suas atividades escravagistas e buscando os rebanhos deixados pelos jesuítas.
No início do século XVIII os europeus e luso-brasileiros começam a marcar sua presença na região, representados por tropeiros e contrabandistas de gado. Em 1807, o Rio Grande do Sul cria a sua primeira estrutura administrativa territorial, formando quatro municípios. Um deles era Santo Antônio da Patrulha, que integrou o município de Jaquirana em seu território até 1878. A partir daí, a região onde hoje é Jaquirana passa a pertencer a São Francisco de Paula, emancipando-se em 1987.
O nome do município é de origem indígena e significa cigarra cantadeira.
Atrativos
Em Flores da Cunha
Museu Padre Alberto Lamonatto.
O museu está instalado dentro do prédio da subprefeitura de Otávio Rocha, que também pelas suas características construtivas merece destaque. Hoje, além dos serviços administrativos do distrito, acolhe o acervo histórico doado pe.
Veja mais informações de Museu Padre Alberto Lamonatto.
É constituída por um conjunto de réplicas de prédios históricos de diferentes regiões da Itália. Nos seis prédios, La Rotonda, Castelo Inferiore di Marostica, Casa di Giulietta, Casa di Romeo, Il Colosseo (em fase de construção) e.
A casa Dona Zilba, foi construída em 1896, e faz parte do centro histórico tombado pelo IPHAN. A casa abriga a história da família de Zilba Grazziotin, filha mais nova de imigrantes italianos. Esta, sempre fez questão de manter os móveis, objetos e documento.
