Na época do descobrimento, o vasto planalto hoje pertencente ao território de Jaquirana era ocupado por índios Kaigangs.
No século XVII, chegaram os missionários jesuítas e implantaram a criação extensiva de gado. Os bandeirantes paulistas também lá estiveram, exercendo suas atividades escravagistas e buscando os rebanhos deixados pelos jesuítas.
No início do século XVIII os europeus e luso-brasileiros começam a marcar sua presença na região, representados por tropeiros e contrabandistas de gado. Em 1807, o Rio Grande do Sul cria a sua primeira estrutura administrativa territorial, formando quatro municípios. Um deles era Santo Antônio da Patrulha, que integrou o município de Jaquirana em seu território até 1878. A partir daí, a região onde hoje é Jaquirana passa a pertencer a São Francisco de Paula, emancipando-se em 1987.
O nome do município é de origem indígena e significa cigarra cantadeira.
Atrativos
Em Nova Pádua
Cachoeirão do Rio das Antas.
Formação rochosa em meio ao Rio das Antas, que chegam a altura de 15 metros, formando quedas e corredeiras..
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Localizadas na estrada Julio de Castilhos, a, aproximadamente, 6 km do centro da cidade, as Cascatas da Usina configuram-se em belas quedas d’águas, onde o visitante pode apreciar as incríveis belezas naturais. No local há três plataformas para visualizaç&atil.
O parque Cascata dos Monges foi inaugurado no dia 06 de novembro de 1998. Há milhões de anos, o contato da água com a rocha, possibilitou a formação de figuras que lembram os três monges.O parque é de propriedade do senhor Carmelindo Andreazza, e possu.
Estes dois rios correm paralelamente, e em certo ponto dos seus cursos, forma-se uma cachoeira entre ambos, com uma queda de mais de 30 metros. Localiza-se na Fazenda Potreirinhos, no 2º distrito do município de São José dos Ausentes, a 32km da sede, com acesso pela estrada.
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