No início da colonização, era apenas uma vila do interior de Veranópolis, conhecida por Pinheiro Seco. Em 1920, passou a ser chamada de Vila Flores, em homenagem à Família Fiori, uma das primeiras a se estabelecerem na localidade. Emancipou-se em 12 de maio de 1988.
O povoado formou-se a partir da Casa Fiori, onde no início do século passado funcionava o maior estabelecimento comercial da região. O local foi porto de pouso dos carreteiros que transportavam madeira para Porto Alegre.
As toras eram levadas até o rio das Antas e amarradas na forma de balsas. Quando a água subia, as madeiras eram colocadas no rio para descerem flutuando até a capital gaúcha. Hoje, a cidade de Vila Flores é ponto de referência de religiosos que vêm em busca do famoso vinho de missa, fabricado no Seminário dos Freis Capuchinhos.
Atrativos
Em Flores da Cunha
Torre e Igreja Santa Juliana.
Igreja e Torre da Capela Santa Juliana localizada no Distrito de Mato Perso..
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A Igreja Matriz Cristo Rei, edificada em estilo gótico moderno, foi inaugurada em 14 de novembro de 1954, levando cinco anos para ser construída. Seu interior possui um vão de 40 metros de altura e 3 altares. Numa das naves laterais está localizada a “fonte de &aacu.
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Localizada a, aproximadamente, 1 km do centro da cidade, a Gruta Natural é o retrato da religiosidade de um povo de muita fé. No local encontra-se um campanário em madeira, construído em 1940, abrigando o sino doado na época..
